La facciata principale è piana con grande portale in mattoni sagomati con mosaico nella lunetta datato 1984. Superiormente una finestra arcuata con mostre in mattoni. Il timpano ha cornice intonacata e due piramidi terminali agli angoli. Gli spigoli scendono con due volute che nascondono il tettuccio dell'ispessimento di base. Sulla destra una lapide ricorda il Beato Giacomo da Cerqueto cui si dedica la piazza. A sinistra la chiesa è parzialmente coperta da case, una delle quali è la canonica che fa angolo con la facciata e reca il Monumento ai Caduti. Il lato destro mostra, nella parte inferiore la sua maggiore antichità e mostra inoltre variazioni di porte e finestre. A sinistra di questa parte antica c'è la parete riportata a filo e a destra il Campanile in parte aggettante e con leggera e diversa inclinazione. Superiormente la parete è arretrata in corrispondenza del cornicione. Anche il campanile, di buona architettura e sagome in mattoni, parte dal cornicione in su. Il retro del campanile è totalmente in vista, mentre l'abside che ha angolo in pietra lavorata, è in parte coperta da casa ed ha sottogronda un finestrone uguale a quello di facciata, oggi tamponato. Una grande quantità di pietre di recupero ben lavorate formano le pareti della chiesa. La struttura è realizzata in muratura mista intonacata con lesene e stucchi di ordine ionico e cornicione sull'intero perimetro della chiesa. Volta a botte con lunette e quattro finestre solo nell'aula. Le volte sono scandite da fasce piane a leggero risalto. La chiesa oltre ai vertici ricurvi è divisa in quattro campate; una breve verso l'ingresso con i confessionali incassati nel muro e l'altra breve inclusa nel presbiterio; a sinistra di quest'ultimo la porta della sacrestia e a destra un accesso esterno con tre gradini. Le campate centrali, due per parte, contengono quattro altari in nicchia entro arcate. La copertura è lignea, restaurata nel 2009, con manto in tegole e coppi, mentre il pavimento è realizzato in cotto moderno a spina di pesce e presbiterio in Trani. Dietro l'altare maggiore c'è un quadro con la Madre della Misericordia coronata del gennaio 1905. I quattro altari laterali sono rimasti con la coloritura originale. Il presbiterio venne realizzato nel 2000, tutto in marmo compreso la nuova fonte battesimale e l’elemento decorativo posto sotto il tabernacolo, realizzato in occasione dell’anno giubilare. L'altare contiene le spoglie (rivestite in cera) del Beato Giacomo da Cerqueto. La sede è in legno; la sponda della stessa è il gradino del precedente altare ed ha tre nicchie con statue di gesso pre-esistenti. Le statue erano originariamente cinque, cioè Gesù e i quattro Evangelisti. Il 21 aprile 1956 il corpo del Beato Giacomo da Cerqueto, frate agostiniano (1284-1367) che dopo la sua morte riscosse culto pubblico, venne trasferito dalla chiesa degli Agostiniani di Perugia a quella di Cerqueto e collocato sotto l'altare maggiore.